Selon la Loi du 5 mai 1997, la principale mission de la CIDD consiste à préparer et à assurer le suivi du Plan fédéral quadriennal de développement durable (PFDD). La CIDD a la responsabilité de l'élaboration d'un avant-projet de PFDD soumis à une large consultation publique. Elle traite les avis et observations reçus lors de cette consultation et les intègre dans ce qui devient le projet du PFDD. Le projet ainsi remanié est ensuite soumis au Conseil des ministres. C'est finalement le Roi qui fixe le PFDD par arrêté royal délibéré en Conseil des ministres.
Lorsque le Plan Fédéral du Développement durable (PFDD) est approuvé, la CIDD assure le suivi de sa mise en oeuvre, notamment via la coordination des rapports annuels que ses membres rédigent sur la politique de développement durable menée dans les services publics fédéraux et organismes publics. La CIDD rédige chaque année, pour le 31 mars, un rapport sur ses activités de l'année précédente. Ce rapport est transmis, avec le rapport des membres, au Gouvernement fédéral, aux Chambres législatives et au Conseil fédéral du développement durable (CFDD).
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